市档案馆现馆藏文书档案分别设立为112个全宗。其中联合全宗4个，即：中共嘉峪关市委全宗（市委各工作部门1972年至1992年形成的档案为联合全宗，1993年以后单独分设全宗）、嘉峪关市革命委员会全宗、嘉峪关市农林局全宗、嘉峪关市商业局全宗。其他主要全宗设立情况：嘉峪关市人大常委会设一个全宗，嘉峪关市政府设一个全宗，嘉峪关市政协设一个全宗，各群众团体组织分别设立全宗，市直县团级以上各职能部门分别设立全宗。1969年至1971年嘉峪关地区总指挥部、1974年至1976年嘉峪关地区民兵指挥部、1965年至1966年中共嘉峪关市委“四清”运动工作队、1984年至1987年中共嘉峪关市委整党工作办公室、1972年至1974年嘉峪关市嘉峪关区形成的档案各自设立全宗。各群众团体分别设立全宗，市直县团级以上各职能部门分别设立全宗。